在根管治疗的过程中,大多采用根管专用器械去除感染牙髓的过程，把感染牙质和毒性分解出来，并填塞牙齿的根管，这样就杜绝了细菌进入，防止了牙齿的再感染状况，也可防治牙根病变，进而促进牙齿根尖疾病的尽快愈合。可以说是牙齿治疗之中最好的手术，也是当今对这类疾患最好的治疗办法，也得到了全世界具有此类病症患者的认可，可以说是目前最有效的手段之一。但是万事都有利有弊，有好的一面也有着坏的一面，所以说，根管治疗危害也有一些，这在人们手术中不可不防，只有认识了才可以趋利避害，让人们的牙齿更加的健康。
根管治疗的手术繁琐，一般要2-4次就诊才能完成。病人可能会觉得麻烦，承受的痛苦较多;
其次，根管治疗后，失去牙神经(牙髓)的牙齿，成为死髓牙。死髓牙相对于活髓牙，由于其失去营养供给，脱水后其强度降低，韧性变差，变得比较松脆。容易折断。
再者，如果医生的水平不足，根管治疗就可能失败，消毒不彻底导致牙髓腔再次感染，导致需要拔牙。如果具有4根根管的臼齿，第四根根管容易被错过，导致失败。另外形状异常的根管，消毒充填过程中也可能不彻底。
