只要是侵入式的手术，哪怕只是微整形，也有其相应的风险，纹眉纹眼线除了术后形状、色彩效果不好，还可能由于医生手术前、手术中消毒不严格，不遵守无菌操作规程或者患者手术后不认真保护造成局部的感染。
交叉感染由于肝炎、艾滋病等病毒均可通过血液、泪液、唾液等传播，因此稍不注意就会造成医源性交叉感染。主要是因为文刺针具消毒不严格，多人共用文刺针具;特别是一些无任何医学知识的人也从事文眉工作，有时对文刺针具根本不消毒。有些美容师仅用传统的酒精或新洁尔灭消毒。这些消毒药剂对乙型肝炎病毒、艾滋病病毒无杀灭作用，所以造成交叉感染。
眉色和眼线不理想或脱色两侧眉形和眼线不对称，造成各种怪眉形和眼线。
损伤眼球电动纹眉机纹刺速度较快，纹眉针尖锐，若安置不牢固，纹眉针脱落，或者操作者疏忽，可能误伤眼球。
药物过敏包括麻醉药物、消毒液和纹眉色料过敏。
心理障碍少数人纹眉和纹眼线后因为没有收到预期效果，想美容，反而丑容甚至毁容，出现忧虑、自卑、精神不振等心理障碍。
