阴蒂肥大在确诊前必须与男性假两性畸形及女性假两性畸形相鉴别。阴蒂肥大常与遗传基因有关，由胚胎发育期在遗传基因控制下生殖结节发育异常所致；后天获得性则常与内分泌紊乱有关，即雄性激素相对增高。一旦性别确诊为属女性或男性性腺和性器官发育不良且长期以女性生活者，可按女性治疗。对肥大的阴蒂宜行部分阴帝切除术。
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目前做阴蒂体切除手术一般使用的方法如下：
1.麻醉和体位：局部麻醉，取膀胱截石位。
2.局麻后在阴蒂背侧包皮处做半环状切口，并在阴蒂腹侧下方做“人”形切口。
3.适当分离周围皮瓣，暴露阴蒂体部，将阴蒂头保留(以蒂与尿道口周围组织相连)，切除阴蒂体。
4.将阴蒂头与皮瓣相缝合，剪除多余皮瓣后再将其他缝合。
阴蒂体切除手术的优点如下：使得阴蒂肥大恢复正常。
